Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LTBP3Q9NS15 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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