Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms