Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHST12Q9NRB3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHST12Q9NRB3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHST12Q9NRB3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHST12Q9NRB3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHST12Q9NRB3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms