Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms