Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM5Q9NQX1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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