Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZCCHC17Q9NP64 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC17Q9NP64 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms