Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms