Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLSPNQ9HAW4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms