Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms