Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D4AQ9H788 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms