Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF39Q9H2S5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF39Q9H2S5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms