Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTIF3Q9H2K0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms