Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP44Q9H0E7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP44Q9H0E7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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