Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM8Q9BZR9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM8Q9BZR9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms