Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms