Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARD11Q9BXL7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARD11Q9BXL7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARD11Q9BXL7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CARD11Q9BXL7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARD11Q9BXL7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARD11Q9BXL7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARD11Q9BXL7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARD11Q9BXL7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARD11Q9BXL7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARD11Q9BXL7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARD11Q9BXL7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARD11Q9BXL7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms