Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf16Q9BUW7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms