Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LARP6Q9BRS8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms