Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LPIN3Q9BQK8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms