Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

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Length 3,911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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AKAP9Q99996 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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AKAP9Q99996 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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AKAP9Q99996 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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AKAP9Q99996 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP9Q99996 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP9Q99996 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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