Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED1Q99966 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms