Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN18Q99952 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN18Q99952 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms