Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5SQ99766 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP5SQ99766 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms