Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POP1Q99575 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POP1Q99575 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POP1Q99575 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP1Q99575 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP1Q99575 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP1Q99575 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP1Q99575 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POP1Q99575 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP1Q99575 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POP1Q99575 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POP1Q99575 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POP1Q99575 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
POP1Q99575 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POP1Q99575 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POP1Q99575 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POP1Q99575 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms