Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EYA3Q99504 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms