Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RUFY1Q96T51 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms