Protein–RNA interactions for Protein: Q96QZ0

PANX3, Pannexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX3Q96QZ0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PANX3Q96QZ0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PANX3Q96QZ0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms