Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PNMA5Q96PV4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA5Q96PV4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA5Q96PV4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA5Q96PV4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA5Q96PV4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA5Q96PV4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA5Q96PV4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA5Q96PV4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA5Q96PV4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA5Q96PV4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA5Q96PV4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA5Q96PV4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA5Q96PV4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PNMA5Q96PV4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms