Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SORCS2Q96PQ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms