Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCLT1Q96NL6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms