Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF558Q96NG5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms