Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF396Q96N95 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms