Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCMTD1Q96MG8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms