Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT74Q96LB3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms