Protein–RNA interactions for Protein: Q96L14

CEP170P1, Cep170-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170P1Q96L14 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP170P1Q96L14 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP170P1Q96L14 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms