Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms