Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CELF6Q96J87 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms