Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TPD52L3Q96J77 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms