Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUCLG2Q96I99 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms