Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BICD1Q96G01 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms