Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms