Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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NEURL3Q96EH8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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NEURL3Q96EH8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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NEURL3Q96EH8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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NEURL3Q96EH8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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NEURL3Q96EH8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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NEURL3Q96EH8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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NEURL3Q96EH8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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NEURL3Q96EH8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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NEURL3Q96EH8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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NEURL3Q96EH8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEURL3Q96EH8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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