Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTERF3Q96E29 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTERF3Q96E29 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms