Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFHD2Q96C19 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFHD2Q96C19 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EFHD2Q96C19 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EFHD2Q96C19 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EFHD2Q96C19 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EFHD2Q96C19 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHD2Q96C19 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms