Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJA10Q969M2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms