Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HLA-CQ95604 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms