Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA6Q92908 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms