Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABGGTAQ92696 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
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