Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms