Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP133Q8WUM0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NUP133Q8WUM0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms